PRESENTATION DE LA DIARRHEE VIRALE BOVINE (BVD)
Outils de diagnostic de laboratoire pour la dรฉtection dโune circulation du virus
Des mรฉthodes de diagnostic direct (par dรฉtection du virus BVD) ou indirect (par dรฉtection des anticorps produits ร la suite dโune infection ou dโune vaccination) existent.
Pour rappel, voici un apercu des statuts sรฉrologiques et virologiques possibles des bovins en ce qui concerne le BVDv.
Dรฉtection du virus BVD
La culture cellulaire est la mรฉthode de rรฉfรฉrence, la plus sensible, pour la dรฉtection du virus BVDv chez les animaux infectรฉs de plus de 3 mois (aprรจs disparition des Ac maternels). Cette mรฉthode permet ร elle seule de dรฉterminer le caractรจre cytopathogรจne ou non dโune souche de BVDv. Historiquement, ce ยซ gold standard ยป a laissรฉ place aux techniques de dรฉtection de protรฉine antigรฉnique virale (ELISA Ag) et dโamplification gรฉnique (RT-PCR).
Culture cellulaire et isolement viral
La technique repose sur une inoculation dโune culture de cellules-cibles (prรฉfรฉrentiellement des cellules embryonnaires de cornets nasaux par exemple) ร lโaide de lโรฉchantillon ร tester. Lโincubation dure plusieurs jours (4 ร 5). Ce temps est suffisant pour lโisolement du BVDv. Suite ร cela, les cellules sont testรฉes par immunofluorescence ou immunopรฉroxydase afin dโidentifier le virus. Lโรฉchantillon de choix pour isoler le virus BVD est un prรฉlรจvement dโune fraction de cellules blanches extraites ร partir de sang total de bovin. On prรฉfรจrera utiliser les organes lymphoรฏdes (rate, nลuds lymphatiques mรฉsentรฉriques, thymus et plaques de Peyer de lโintestin grรชle) si lโanimal est retrouvรฉ mort3. Chez les animaux IPI, nโimporte quel รฉchantillon prรฉlevรฉ pourra รชtre utilisรฉ grรขce ร la quantitรฉ de virus prรฉsents dans lโorganisme. La conservation du virus est relativement bonne et un envoi dโรฉchantillons congelรฉs ou rรฉfrigรฉrรฉs pendant quelques jours ne modifie pas la qualitรฉ de lโisolement viral. Cependant, on dรฉnote plusieurs inconvรฉnients sur cette mรฉthode, sa sensibilitรฉ (elle reste moins sensible que la RTPCR) et le risque de nombreux faux nรฉgatifs (notamment avant disparition totale des Ac neutralisants colotraux chez les IPI et chez les IT oรน une rรฉponse immunitaire est en place)37,38.
Dรฉtection du virus BVD et de ses acides nuclรฉiques par PCR
Lโamplification du gรฉnome ARN du virus est possible mรชme si lโรฉchantillon rรฉcoltรฉ ne contient que peu de matรฉriel viral. Cependant, cette mรฉthode nรฉcessite une amorce capable de reconnaรฎtre tous les types antigรฉniques (type BVDv-1a, BVDv-1b, BVDv-2โฆ). Les รฉchantillons recommandรฉs sont les fluides acellulaires (sรฉrum, plasma, surnageant de culture cellulaire) ou du sang total sur milieu EDTA. Les รฉchantillons cellulaires (lait, organeโฆ) pourront รฉgalement servir de matrice ร la dรฉtection de virus. La PCR est 10 ร 1000 fois plus sensible et plus spรฉcifique que la technique prรฉcรฉdente dโisolement viral et permet la dรฉtection dโune quantitรฉ infime de gรฉnome viral39 et la diffรฉrenciation du type dโinfection (IT/IPI). Grรขce ร elle, il est possible de rรฉaliser des mรฉlanges (pools) dโรฉchantillons (10 ร 20) de sang mais aussi de lait de grand mรฉlange prรฉlevรฉ dans le tank. De plus, cette technique permet dโรฉviter les faux nรฉgatifs par interfรฉrence avec les anticorps colostraux fournis par la mรจre.
Dรฉtection des antigรจnes viraux par la technique ELISA
LโELISA Ag (ยซ Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay ยป ou ยซ dosage dโimmunoabsorption par une enzyme liรฉe ยป) permet une dรฉtection des antigรจnes viraux.
Cette technique est intermรฉdiaire entre la culture cellulaire et la PCR au niveau de sa rapiditรฉ et son coรปt pour lโidentification dโun virus. Concernant sa sensibilitรฉ, elle est moins sensible pour la dรฉtection des animaux infectรฉs transitoires mais reste bonne (proche de celle du gold standard2) pour la dรฉtection dโun individu IPI dont le titre viral est trรจs รฉlevรฉ.
Deux mรฉthodes sont connues : lโELISA avec capture dโantigรจne et la coloration immunohistochimique (IHC) sur tissus frais.
LโELISA avec capture dโantigรจne repose sur une mรฉthode de dรฉtection dโantigรจne viral en ยซ sandwich ยป. Tout dโabord une plaque de micro-titrage tapissรฉe dโun mรฉlange dโanticorps monoclonaux est synthรฉtisรฉe. Elle servira ร fixer les antigรจnes si ces derniers sont prรฉsents dans le sรฉrum. Enfin, un mรฉlange contenant des anticorps monoclonaux conjuguรฉs ร une enzyme rรฉvรฉlatrice (peroxydase) est ajoutรฉ. Ainsi, ces anticorps viendront prendre en ยซ sandwich ยป les antigรจnes recherchรฉs qui sont : NS2-3 (protรฉine non structurale conservรฉe chez les Pestivirus), E0 et E2 (protรฉines structurales variant au cours des mutations par rรฉplication).
LโIHC est une technique rรฉalisรฉe sur des prรฉlรจvements provenant de biopsies dโoreilles, aussi appelรฉs ยซ ear notch ยป. Une fois collectรฉs, ces รฉchantillons seront tout dโabord fixรฉs dans du formol pour leur transport. A leur arrivรฉe au laboratoire ils seront paraffinรฉs, dรฉbitรฉs en fines lamelles et rรฉhydratรฉs. Pour finir, ils subiront une coloration par IHC avant dโรชtre analysรฉs par lecture microscopique.
Mรฉthodes de dรฉtection sรฉrologique
Les anticorps spรฉcifiques du virus BVD sont produits ร la suite dโune exposition naturelle ร une souche sauvage ou dโune vaccination sur un individu immunocompรฉtent. Deux catรฉgories de techniques se distinguent pour la mise en รฉvidence de ces anticorps : les tests de nature enzymatiques (ELISA indirect ou de compรฉtition) et la sรฉroneutralisation.
Test de sรฉroneutralisation
La technique de sรฉroneutralisation est une technique quantitative permettant de connaรฎtre le taux dโanticorps dirigรฉs contre le BVDv dans le sรฉrum testรฉ. Ce dernier est diluรฉ avant dโรชtre mรฉlangรฉ avec la suspension virale. Aprรจs incubation le mรฉlange est rรฉparti de faรงon homogรจne sur une culture cellulaire de lโhรดte du virus. Aprรจs quelques jours, la concentration du virus (en unitรฉ formant plage UFP) peut รชtre estimรฉe, par lyse cellulaire si une souche cyto-pathogรจne (CP) a รฉtรฉ utilisรฉe ou par immunofluorescence directe ou indirecte si une souche NCP a รฉtรฉ utilisรฉe. La concentration en anticorps anti-BVD sรฉrique de lโindividu est calculรฉe par les plages oรน lโensemble du virus nโa pu รชtre neutralisรฉ par les anticorps. Considรฉrรฉe comme la mรฉthode de rรฉfรฉrence pour la dรฉtection des anticorps sรฉriques dโun individu testรฉ, elle est sensible et spรฉcifique, mais difficile ร mettre en place ร lโรฉchelle dโun cheptel car elle reste coรปteuse et le dรฉlai dโattente est de plusieurs jours. Les tests immunoenzymatiques (ELISA) sont donc prรฉfรฉrรฉs.
Test immunoenzymatiques (ELISA)
Ces tests sโeffectuent sur des รฉchantillons individuels de sรฉrum et sont les tests les plus frรฉquemment utilisรฉs en routine39. Les deux principales techniques sont lโELISA de compรฉtition et lโELISA indirect.Une microplaque sur laquelle sont fixรฉs des antigรจnes du virus BVD (souvent une protรฉine conservรฉe telle que NS2-3) est utilisรฉe. Du sรฉrum ร tester est versรฉ, si celui-ci contient les anticorps spรฉcifiques pour lโantigรจne fixรฉ sur la microplaque, ceux-ci se fixent sur les antigรจnes. Aprรจs un simple rinรงage, des anticorps anti-immunoglobulines spรฉcifiques dโespรจces couplรฉes ร une enzyme peroxydase se fixent ร lโanticorps de lโรฉchantillon ร tester. Lโenzyme, en prรฉsence de son substrat chromogรจne รฉmet un signal lumineux. Ce dernier est proportionnel ร la quantitรฉ dโenzymes prรฉsentes et ainsi ร la concentration dโanticorps recherchรฉs. La microplaque est lue par spectrophotomรจtre. Le tableau 5 rรฉsume les mรฉthodes de dรฉtection, leurs points forts et leurs points faibles.
Guide du mรฉmoire de fin d’รฉtudes avec la catรฉgorie Contrรดle et รฉradication de la diarrhรฉe virale bovine (BVD) en Europeย |
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Table des matiรจres
TABLE DES ANNEXES
TABLE DES ILLUSTRATIONS
LISTE DES ABBREVIATIONS
I. INTRODUCTION
II. PRESENTATION DE LA DIARRHEE VIRALE BOVINE (BVD)
1. Historique
2. Pathogรฉnie et consรฉquences cliniques des infections transitoires et persistantes
a. Infection transitoire hors gestation
b. Infection transitoire en pรฉriode de gestation
c. Infection persistante
3. Epidรฉmiologie du virus BVDv
a. Epidรฉmiologie descriptive
b. Epidรฉmiologie analytique
4. Outils de diagnostic de laboratoire pour la dรฉtection dโune circulation du virus
a. Dรฉtection du virus BVD
b. Mรฉthodes de dรฉtection sรฉrologique
5. Contrรดle et รฉradication de la diarrhรฉe virale bovine (BVD) en Europe
a. En Allemagne
b. En Suรจde
c. En Suisse
d. En Norvรจge
e. En Autriche
f. En Ecosse
g. Aux Pays-Bas
h. En France
III. MATERIELS ET METHODES
1. Sรฉlection des articles
2. Construction des bases de donnรฉes
a. Objectifs des jeux de donnรฉes
b. Prรฉsentation des paramรจtres dโintรฉrรชt
c. Les jeux de donnรฉes
3. Mรฉta-Regression
a. Nature du modรจle
b. Biais dโรฉtudes et de publications
c. Conduite de la mรฉta-rรฉgression
d. Sensibilitรฉ du modรจle principal
IV. RESULTATS
1. DS 1 : Estimation du coรปt individuel (par vache) annuel dโune infection par le BVDv
a. Modรจle principal
b. Modรจles dissidents
2. DS 2 : Evaluation de la baisse du coรปt individuel (par vache) de la circulation du virus aprรจs mise en place dโune mesure de contrรดle (vaccination, biosรฉcuritรฉ et dรฉtection/รฉlimination des IPI) 60
V. DISCUSSION
1. Mรฉthodes utilisรฉes
2. Rรฉsultats
VI. CONCLUSIONS
VII. REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
VIII. ANNEXES
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