Table des matières
Liste des figures et tableaux
GLOSSAIRE
INTRODUCTION
Définitions générales des termes et concepts
Le porc, l’Homme et les zoonoses.
L’Asie, zone de notre étude
PREMIÈRE PARTIE : L’ENCÉPHALITE JAPONAISE
Structure du virus en cause, les protéines synthétisées et leur fonction, classification, les I.différents génotypes identifiés et les modalités de réplication virale
Épidémiologie de l’infection et de la maladie
Épidémiologie descriptive
Historique de l’EJ
Répartition et propagation géographique des différents génotypes du VEJ
Épidémiologie de l’EJ : distinction de trois zones différentes (Bourgeade et Marchou, 2003 ; Misra et Kalita, 2010)
Expansion géographique de l’EJ et pays touchés
Nombre de cas d’EJ chez l’Homme dans le monde
Étude par pays (année d’apparition des premiers cas, incidence annuelle actuelle
Estimation de l’incidence annuelle mondiale de l’EJ selon une étude récente
Age des personnes les plus touchées
Épidémiologie analytique : acteurs intervenant dans la transmission du VEJ et modalités de cette transmission
Cycle épidémiologique du VEJ, un arbovirus
Maintien du VEJ pendant la saison froide (Van den Hurk et al., 2009 ; Misra et Kalita, 2010)
Périodes correspondant à des pics de transmission du VEJ
Facteurs à l’origine de la propagation du VEJ et donc de l’émergence de la maladie
Intensification de la riziculture, croissance démographique et augmentation de la production porcine
Impact du réchauffement climatique sur les populations vectorielles
Transport des moustiques et mouvements des oiseaux migrateurs
Aspects cliniques
Chez l’Homme
Symptômes
Infections symptomatiques versus infections asymptomatiques et facteurs intervenant dans la gravité de la maladie
Description des formes symptomatiques
Pronostic et séquelles
Lésions
Chez le porc
Pathogénie de l’infection
Diagnostic de la maladie
Chez l’Homme
Chez le porc
Moyens de lutte
Traitement de l’infection chez l’Homme
Prophylaxie médicale
Chez l’Homme
Chez le porc
Chez les oiseaux
Méthodes de contrôle des populations vectorielles
Mesures de contrôle environnementales
Utilisation de « l’irrigation intermittente »
Délocalisation des élevages porcins
Mesures de contrôle biologiques
Utilisation de bactéries
Utilisation de nématodes
Utilisation de poissons larvivores
Zooprophylaxie
Autres méthodes
Mesures de contrôle chimiques
Diminution de l’exposition aux populations vectorielles
Méthodes de surveillance de l’EJ
Succès du contrôle de l’EJ dans certaines régions
Quelle menace représente l’EJ pour les années à venir ?
L’EJ, représente-elle une menace pour le reste du monde ?
Propagation de l’EJ des zones rurales aux zones urbaines
Modification progressive de l’importance des différents génotypes du VEJ
Domaines d’étude à privilégier dans le futur
DEUXIÈME PARTIE : L’HÉPATITE E ZOONOTIQUE
Structure du virus en cause, les protéines synthétisées et leur fonction, classification, les I.différents génotypes et les modalités de réplication virale
Épidémiologie de l’infection et de la maladie
Épidémiologie descriptive
Historique de la maladie
Importance de l’HE chez l’Homme
Distribution géographique des différents génotypes du VHE
Épidémiologie analytique
Preuves de la transmission zoonotique des VHE de génotypes 3 et 4
Implication du porc en tant que réservoir
Rôle des suidés sauvages
Diversité et potentiel zoonotique des VHE présentes chez les animaux autres que les suidés
Une transmission autre que zoonotique des VHE de génotypes 3 et 4 ?
Modalités de la transmission
Modes de transmission du VHE entre les suidés
Modes de transmission à l’Homme des génotypes zoonotiques du VHE
Facteurs de risque de la maladie et professions à risque
Aspects cliniques
Chez l’Homme
Symptômes
Lésions
Chez le porc
Pathogénie de l’infection
Diagnostic de la maladie
Moyens de lutte
Traitement de l’infection chez l’Homme
Prophylaxie médicale
Prophylaxie sanitaire de l’HE zoonotique
Domaines d’étude à privilégier dans le futur
TROISIÈME PARTIE : LES GRIPPES ZOONOTIQUES IMPLIQUANT LE PORC
Les virus Influenza (VI)
Classification, structure, propriétés et protéines virales synthétisées
Variabilité des VI
Modalités de réplication virale
VI et barrière d’espèce
Généralités : mécanismes génétiques en cause
Les VI, un génome collectif ? Infection du porc et potentiel zoonotique des virus présents chez le porc : mécanismes et aspects descriptifs
Interactions hôtes-virus et transgression de la barrière d’espèce
Épidémiologie descriptive de l’infection de l’Homme par des VI transmis par le porc
Transmission zoonotique à l’Homme de virus porcins
Virus humains réassortants issus d’un réassortiment qui a eu lieu chez le porc
Transmission zoonotique à l’Homme de virus aviaires
Bilan
Épidémiologie descriptive de l’infection chez le porc
Diversité et importance des VI porcins
Transmission au porc de VI aviaires
Transmission au porc de VI humains
Bilan sur la diversité et l’importance des VI chez le porc en Asie
Les porcs, des « creusets de mélange » (mixing-vessel) majeurs
Rôle des autres animaux dans le cycle de transmission des grippes humaines
Épidémiologie analytique
Réservoir des VI
Transmission du virus entre les porcs
Transmission des VI à l’Homme
Facteurs de risques de transmission de VI porcins à l’Homme
Aspects cliniques
Chez l’Homme
Chez le porc
Symptômes
Lésions
Pathogénie de l’infection
Diagnostic
Moyens de lutte
Traitement de l’infection chez l’Homme
Prophylaxie médicale : vaccins utilisés ou en cours de développement
Prophylaxie sanitaire et mesures de contrôle et de surveillance de la maladie
Prophylaxie sanitaire
Surveillance des VI
Importance de la mise en place d’une surveillance des VI et obstacles rencontrés
Programmes de surveillance existant actuellement
Systèmes de surveillance à privilégier en Asie
Nouvelles approches
Inquiétudes majeures pour l’avenir
QUATRIÈME PARTIE : LA MALADIE DUE AU VIRUS NIPAH
Structure du virus en cause, les protéines synthétisées et leur fonction, classification et I.modalités de la réplication virale
Épidémiologie de l’infection et de la maladie
Épidémiologie descriptive
Description de l’épidémie malaise
Cas humains au Bangladesh et en Inde
Cas de Nipah chez les animaux
Épidémiologie analytique : acteurs et facteurs de risque de la transmission
Réservoir du virus
Transmission du virus au porc et entre porcs
Transmission du virus à d’autres espèces animales
Transmission du virus à l’Homme
Diversité génétique des souches de NiV
Aspects cliniques
Chez l’Homme
Symptômes
Lésions
Chez le porc
Symptômes
Lésions
Autres espèces animales
Pathogénie de l’infection
Récepteur cellulaire du NiV
Tropisme du NiV
Voie d’entrée, dissémination et pathogénie du virus
Diagnostic de la maladie
Moyens de lutte
Traitement de l’infection chez l’Homme
Prophylaxie médicale
Prophylaxie sanitaire et mesures de contrôle et de surveillance de la maladie
Origine de l’émergence du NiV
Premières hypothèses et implication des modifications d’origine anthropogénique dans l’émergence du NiV
Émergence du NiV en Malaisie
CINQUIÈME PARTIE : STREPTOCOCCIE À STREPTOCOCCUS SUIS
La bactérie en cause : Streptococcus suis
Épidémiologie de l’infection et de la maladie
Épidémiologie descriptive
Prévalence des différents sérotypes de S. suis chez les porcs
Prévalence des différents sérotypes de S. suis chez l’Homme
Nombre de cas décrits chez l’Homme et description des épisodes concomitants chez le porc
Épidémiologie analytique
Acteurs et modalités de la transmission210
Réservoir de la bactérie
Modes de transmission chez le porc
Modes de transmission à l’Homme
Prévalence de S. suis dans la viande
Rôle éventuel des autres espèces animales
Particularités des deux épidémies chinoises
Facteurs de risque de la maladie
Personnes les plus touchées
Facteurs de risques de la maladie, particuliers à l’Asie
Aspects cliniques de la maladie
Différentes formes de la maladie et symptômes observés
Chez le porc
Chez les autres espèces animales
Chez l’Homme
Pathogénie de l’infection
Facteurs de virulence potentiels
Voie d’entrée de la bactérie, dissémination dans l’organisme et survie dans le courant sanguin
Passage de la BHE, invasion du SNC et pathogénie au niveau du SNC
Schéma bilan de la pathogénie de l’infection
Mécanismes à l’origine de la surdité séquellaire
Infections liées à d’autres sérotypes que le 2
Diagnostic et dépistage de la maladie
Diagnostic chez les humains et animaux malades
Diagnostic direct
Méthodes bactériologiques classiques
Méthodes moléculaires récentes
Diagnostic indirect
Cas particulier du dépistage de l’infection chez le porc
Méthodes et moyens de lutte
Traitement de l’infection chez l’Homme et le porc
Prophylaxie médicale : vaccins utilisés
Prophylaxie sanitaire et mesures de contrôle et de surveillance de la maladie
Action au niveau de la source (émission) : limitation de l’infection des porcs
Action au niveau de l’Homme : limitation du risque d’exposition
Mesures de prévention
Importance de l’implication des pouvoirs publics et systèmes d’alerte
suis est-il réellement un agent pathogène émergent ou s’agit-il plutôt d’un ancien VI.agent pathogène longtemps négligé?
Origine et mécanismes éventuellement impliqués dans la virulence particulière des souches à l’origine des deux épidémies
Caractérisation par typage moléculaire MLST des souches à l’origine des épidémies chinoises et des souches isolées à travers le monde
Pathogénie particulière du SCTS
Caractéristiques, facteurs de virulence potentiels et îlots de pathogénicité de la souche à l’origine des épidémies chinoises
Augmentation significative du nombre de cas notamment depuis l’épidémie de 2005 : est-elle réelle ou liée à l’amélioration des méthodes de diagnostic et à l’augmentation de l’intérêt scientifique pour la bactérie ?
Bilan
Domaines de recherche à privilégier dans le futur.
SIXIÈME PARTIE : BILAN SUR LES MALADIES ÉTUDIÉES ET ÉTUDE ANALYTIQUE SUR L’ÉMERGENCE DES ZOONOSES LIÉES AU PORC EN ASIE
Bilan sur les maladies étudiées
Facteurs intervenant dans l’émergence des zoonoses liées au porc en Asie et favorisant II.leur transmission à l’Homme
Particularités des agents pathogènes émergents
Notion de barrière d’espèce
Facteurs anthropogéniques susceptibles de favoriser la transmission
Mondialisation des échanges et croissance démographique
Répercussions des actions de l’Homme sur les environnements naturels
Révolution de l’agriculture et de l’élevage porcin
Influence du développement et de l’intensification de l’agriculture
Importance de la production porcine asiatique
Évolution des systèmes de production porcine dans les différents pays asiatiques
Effets de l’intensification des systèmes d’élevage
Proximité entre le porc et l’Homme et rôle des élevages traditionnels encore très nombreux en Asie
Restructuration du secteur de l’abattage et importance des marchés d’animaux vivants et des « wet markets »
Habitudes alimentaires, traditions culturelles et trafic d’animaux
Facteurs anthropogéniques susceptibles de favoriser la sensibilité aux agents pathogènes
Cas particuliers
Rôle des sangliers sauvages
Arboviroses
Prévention, surveillance et lutte contre les zoonoses émergentes, et obstacles rencontrés
Identification tardive des zoonoses émergentes : l’Homme « sentinelle »
Problème de la sous-estimation des cas
Facteurs, acteurs et difficultés du contrôle et de la surveillance des zoonoses
Stratégies mises en place
Est-il possible d’anticiper l’émergence des zoonoses ?
Développement de stratégies à l’échelle régionale : APSED
Développement de stratégies à l’échelle internationale et concept « One Health »
Nouvelles problématiques associées à l’émergence de bactéries antibiorésistantes et IV.leurs implications pour le futur
Émergence d’agents pathogènes antibiorésistants
Facteurs favorisant le développement des résistances
Effets directs et indirects de l’utilisation des antibiotiques chez les animaux sur la santé humaine
Étude de cas : utilisation des antibiotiques dans les élevages porcins au Vietnam
Comment limiter le développement des résistances, et premières stratégies mises en place
Pollution environnementale par les élevages
Menace d’apparition en Asie de nouvelles maladies provenant des pays de l’ouest par le commerce d’animaux : exemple des SARM
Description des SARM
Importance des SARM associés aux animaux de production en Europe et en Amérique du Nord
Importance des SARM associés aux animaux de production en Asie
CONCLUSION
BIBLIOGRAPHIE
ANNEXE
