La myopathie mitochondriale

Table des matières

INTRODUCTION
1 TRAVAIL BIBLIOGRAPHIQUE : ETUDE GENETIQUE DES RHABDOMYOLYSES
1.1 RAPPELS PHYSIOLOGIQUES
1.1.1. TYPOLOGIE MUSCULAIRE
1.1.2. METABOLISME
1.1.2.1 La voie aérobie avec la glycolyse et le cycle de Krebs
1.1.2.2 Les voies anaérobies lactique et alactique
1.1.3. PATHOLOGIES MUSCULAIRES
1.1.3.1 Les glycogénoses
1.1.3.2 L’hyperthermie maligne
1.1.3.3 La myopathie atypique
1.1.3.4 La rhabdomyolyse d’exercice asymptomatique
1.1.3.5 La paralysie hyperkaliémique périodique
1.1.3.6 La myotonie
1.1.3.7 La dystrophie myotonique
1.1.3.8 La myopathie mitochondriale
1.1.3.9 La myopathie fibreuse
1.2 RHABDOMYOLYSES A L’EFFORT
1.2.1. EPIDEMIOLOGIE ET DIAGNOSTIC
1.2.2. PHYSIOPATHOLOGIE
1.2.3. DIAGNOSTIC CLINIQUE ET TRAITEMENT
1.3 LA CARTE GENETIQUE CHEZ LE CHEVAL
1.3.1. LE SEQUENÇAGE DU GENOME DU CHEVAL
1.3.2. LES GENES CANDIDATS IDENTIFIES DANS D’AUTRES ESPECES
1.3.2.1 Le gène du récepteur à la ryanodine du muscle squelettique
1.3.2.2 Le gène CPT II
1.3.2.3 Le gène de la myosine MHC IIa
1.3.2.4 Le gène CPT2
1.3.2.5 Le gène de l’enzyme de branchage pour le glycogène (GBE)
1.3.2.6 Le gène SCN4A
1.3.2.7 Le gène GYS1
1.3.2.8 Les gènes mitochondriaux
1.3.3. LES PUCES ADN OU MICROARRAY OU DAMIER ADN
1.3.3.1 Principe
1.3.3.2 Différents types de puces ADN
1.3.3.2.1 Les puces à ADNc
1.3.3.2.2 Les puces à Oligonucléotides
1.3.3.3 Applications génétiques
1.3.3.4 Une puce oligonucléotide équine
2 TRAVAIL EXPERIMENTAL : MISE EN EVIDENCE DES GENES RESPONSABLES DE RHABDOMYOLYSES
2.1 VALIDATION DE LA METHODE UTILISEE
2.1.1. ANIMAUX MATERIELS ET METHODE
2.1.1.1 Chevaux et biopsies musculaires
2.1.1.2 Extraction de l’ARN total
2.1.1.3 Amplification d’ARN
2.1.1.4 Reverse transcription
2.1.1.5 Production des puces à ADNc
2.1.1.6 Hybridation
2.1.1.6.1 Test inter-spécifique
2.1.1.6.2 Test de reproductibilité
2.1.1.6.3 Test biologique de comparaison musculaire
2.1.1.6.4 Méthode d’hybridation: protocole d’hybridation adaptée par Benchaouir et al., 2004
2.1.1.7 Analyses des données
2.1.1.7.1 Analyse des images
2.1.1.7.2 Filtrage des gènes significatifs et statistiques
2.1.2. RESULTATS
2.1.2.1 Test inter-spécifique
2.1.2.2 Test de reproductibilité
2.1.2.3 Test de comparaison musculaire
2.2 APPLICATION AVEC DES CHEVAUX ATTEINTS DE RHABDOMYOLYSES
2.2.1. ANIMAUX MATERIEL ET METHODE
2.2.1.1 Les animaux
2.2.1.2 Utilisation d’une puce hybride
2.2.1.3 Hybridation
2.2.1.4 Analyse des données à l’aide d’outils bioinformatique de « Data mining »
2.2.2. RESULTATS
2.2.2.1 Classification des 5 groupes de gènes (Clusters) les plus représentatifs
2.2.2.2 Classification des 3 fonctions biologiques les plus représentatives
2.2.2.3 Les 20 gènes les plus représentatifs : sur et sous exprimés dans les muscles atteints
3 DISCUSSION
3.1 DISCUSSION DE LA VALIDATION DE LA METHODE
3.1.1. RESULTATS PRINCIPAUX ET EVALUATIONS DE CES RESULTATS
3.1.1.1 Utilisation de la puce ADN
3.1.1.2 Comparaison de deux muscles
3.1.2. CONFRONTATION AVEC LA LITTERATURE ET PROJETS A VENIR
3.1.2.1 La puce ADN équine
3.1.2.2 La puce : un outil de diagnostic pour les affections musculaires ?
3.2 DISCUSSION DE L’UTILISATION DES PUCES ADN POUR ETUDIER LES TROUBLES FONCTIONNELS DES RHABDOMYOLYSES CHEZ LES CHEVAUX
3.2.1. RESULTATS ET EVALUATION DES RESULTATS
3.2.2. CONFRONTATION AVEC LA LITTERATURE
3.2.2.1 Troubles calciques à l’origine de rhabdomyolyse ?
3.2.2.2 Troubles mécaniques à l’origine de rhabdomyolyse ?
3.2.2.3 Gènes candidats responsables de rhabdomyolyse
CONCLUSION
ANNEXES
BIBLIOGRAPHIE