La structure du virus de Schmallenberg

Table des matières

LISTE DES ABREVIATIONS
TABLE DES ILLUSTRATIONS
INTRODUCTION
PREMIERE PARTIE : RAPPELS SUR LES CONNAISSANCES DU VIRUS SCHMALLENBERG
I.ELEMENTS DE VIROLOGIE ET D’EPIDEMIOLOGIE ANALYTIQUE
1.1. Agent pathogène
1.1.1. Classification
1.1.2. Composition
1.1.3. Propriétés physico-chimiques
1.1.4. Propriétés antigéniques
1.2. Vecteur
1.3. Espèces cibles
1.4. Transmission
II.ASPECTS CLINIQUES ET PATHOGENIE
2.1. Symptômes
2.1.1. Forme aiguë
2.1.1.1. Chez les bovins
2.1.1.2. Chez les petits ruminants
2.1.2. Forme congénitale
2.2. Lésions
2.3. Pathogénie
2.4. Réponse immunitaire
III.DIAGNOSTIC
3.1. Diagnostic clinique
3.2. Diagnostic différentiel
3.2.1. Chez l’adulte
3.2.2. Chez le nouveau-né
3.3. Prélèvements
3.4. Diagnostic de laboratoire
3.4.1. Diagnostic direct
3.4.1.1. RT-qPCR
3.4.1.2. Isolement viral
3.4.2. Diagnostic indirect
3.4.2.1. Séroneutralisation
3.4.2.2. ELISA
3.4.2.3. Immunofluorescence indirecte
3.4.3. Démarche diagnostique
IV.METHODES DE LUTTE
4.1. Vaccination
4.2. Lutte contre les vecteurs
4.3. Lutte sanitaire
DEUXIEME PARTIE : ETUDE DE L’EPIZOOTIE SURVENUE EN 2011 DANS LE NORD DE L’EUROPE ET BILANS DES TROIS SAISONS
I.DEBUT DE L’EPIZOOTIE SURVENUE EN 2011 DANS LE NORD DE L’EUROPE
1.1. Détection des premiers cas en Europe, du mois de novembre 2011 au mois de mars 2012
1.1.1 Novembre
1.1.2. Décembre
1.1.2.1. Pays-Bas
1.1.2.2. Belgique
1.1.3. Janvier
1.1.3.1. Pays-Bas
1.1.3.2. Allemagne
1.1.3.3. Belgique
1.1.3.4. Royaume-Uni
1.1.3.5. France
1.1.4. Février
1.1.5. Mars
1.2. Evolution spatiale et temporelle
1.3. Evolution du SBV durant l’été 2012
1.3.1. Nouveaux pays atteints par le SBV durant l’été 2012
1.3.1.1. Danemark
1.3.1.2. Suisse
1.3.1.3. Autriche
1.3.1.4. Pologne
1.3.1.5. Suède
1.3.1.6. Finlande
1.3.1.7. Irlande
1.3.2. Evolution spatiale et temporelle
1.4. Bilan de la première saison 2011/2012
1.4.1. En Europe
1.4.1.1. Incidence cheptel
1.4.1.2. Séroprévalence
1.4.1.3. Distribution temporelle du nombre de foyers de SBV
1.4.1.4. Distribution géographique des foyers de SBV confirmés de septembre 2011 à octobre 2012
1.4.1.5. Impacts du SBV Bilan
1.4.2. En France
1.4.2.1. Objectifs et modalités de surveillance du SBV congénital entre janvier et août 2012
1.4.2.2. Incidence cheptel
1.4.2.3. Taux d’incidence cheptel
1.4.2.4. Séroprévalence intra-troupeau
1.4.2.5. Evolution dans le temps
1.4.2.6. Evolution spatio-temporelle
1.4.2.7. Répartition géographique
1.4.2.8. Impacts du SBV
1.4.2.9. Conclusion
II.Bilan de la saison 2012/2013
2.1. En Europe
2.1.1. Nouveaux pays atteints
2.1.2. Incidence cheptel
2.1.3. Prévalence
2.1.4. Confirmation biologique
2.1.5. Evolution du nombre de foyers de SBV dans le temps
2.1.5.1. Evolution mensuelle
2.1.5.2. Evolution hebdomadaire par pays
2.1.6. Distribution géographique des foyers de SBV confirmés de septembre 2011 à avril 2013
2.1.7. Conclusion
2.2. En France
2.2.1. Objectif et modalités de surveillance du SBV congénital entre septembre 2012 et août 2013
2.2.1.1. Objectif
2.2.1.2. Définition des cas
2.2.1.3. Modalités diagnostiques
2.2.2. Incidence cheptel
2.2.3. Séroprévalence
2.2.4. Evolution dans le temps
2.2.5. Evolution spatio-temporelle
2.2.6. Répartition géographique
2.2.7. Conclusion
III.Bilan de la saison 2013/2014
3.1. Nouveaux pays atteints en Europe
3.1.1. Serbie
3.1.2. Roumanie
3.1.3. Grèce
3.2. En France
3.2.1. Incidence cheptel
3.2.2. Evolution dans le temps
3.2.3. Répartition géographique
IV.Bilan de trois ans de surveillance et perspectives
TROISIEME PARTIE : ETUDE PERSONNELLE
I.CONTEXTE
II.OBJECTIFS
III.MATERIEL ET METHODES
3.1. Définitions des cas cliniques suspects.
3.2. Analyses de laboratoire
3.2.1. Laboratoires réalisant les analyses
3.2.2. Les prélèvements réalisés
3.2.3. Analyses
3.3. Fiche de renseignements
3.4. Analyses statistiques
IV.RESULTATS
4.1. Description brute des résultats
4.1.1. Description de l’échantillon
4.1.1.1. Composition de l’échantillon et nombre de cas confirmés
4.1.1.2. Répartition géographique des suspicions cliniques
4.1.2. Les signes cliniques
4.1.2.1. Score clinique
4.1.2.2. Les signes nerveux
4.1.3. Résultats de sérologie et PCR chez les mères
4.2. Résultats des analyses bivariées
4.2.1. Lien entre les résultats de la RT-qPCR et le type de prélèvement réalisé chez le suspect clinique
4.2.2. Lien entre les résultats de la RT-qPCR et le stade de gestation auquel est né le suspect clinique
4.2.3. Lien entre les résultats de la RT-qPCR et l’espèce du suspect clinique
4.2.4. Lien entre les résultats de la RT-qPCR et le score clinique du suspect clinique
4.2.5. Lien entre les résultats de la RT-qPCR et la présence de signes nerveux chez l’individu suspect clinique
4.2.6. Régression logistique
V.DISCUSSION
CONCLUSION
ANNEXES
BIBLIOGRAPHIE