Stratification du contenu ruminal

Table des matières

Table des figures
Table des tableaux
INTRODUCTION
PREMIERE PARTIE : ETUDE BIBLIOGRAPHIQUE
1. Le Rumen
1.1. Anatomie du rumen
1.1.1. Conformation externe
1.1.2. Conformation interne
1.1.3. Topographie
1.2. Paramètres physico-chimiques du réticulo-rumen
1.2.1. L’anaérobiose
1.2.2. Le pH
1.2.3. La température
1.2.4. Le potentiel d’oxydo-réduction
1.2.5. La pression osmotique
1.3. Stratification du contenu ruminal
1.4. Motricité du réticulo-rumen
2. Environnement microbien du rumen
2.1. Les bactéries
2.1.1. Les bactéries fibrolytiques
2.1.2. Les bactéries amylolytiques et utilisatrices des glucides simples
2.1.3. Les bactéries utilisatrices de lactate
2.1.4. Les bactéries protéolytiques
2.1.5. Les bactéries transformant les lipides
2.2. Les protozoaires
2.3. Les champignons
2.4. Variations du microbiote ruminal
2.4.1. Variations physiologiques
2.4.2. Variations pathologiques (dysbioses)
3. Digestion des aliments d’origine végétale par les micro-organismes ruminaux
3.1. Digestion des glucides
3.1.1. Dégradation des glucides pariétaux
3.1.2. Dégradation de l’amidon
3.1.3. Métabolisme bactérien des oses simples
3.1.4. Devenir des produits terminaux de la digestion des glucides
3.1.5. Facteurs de variation de la fermentation des glucides
3.2. Digestion des lipides
3.2.1. Lipolyse des lipides alimentaires
3.2.2. Biohydrogénation des acides gras insaturés
3.2.2.1.Biohydrogénation de l’acide linoléique
3.2.2.2.Biohydrogénation de l’acide α-linolénique
3.2.3. Facteurs de variation du métabolisme lipidique
3.2.4. Facteurs de variation de la proportion en isomères trans 11 et trans 10
DEUXIEME PARTIE : EXPERIMENTATION
1. Matériels & Méthodes
1.1. Conditions de cultures
1.1.1. Inoculum
1.1.2. Solutions tampons
1.1.3. Substrats
1.1.4. Déroulement des cultures
1.2. Mesure des activités microbiennes
1.3. Mesure des activités enzymatiques
1.4. Analyses
1.4.1. Dosage des acides gras
1.4.2. Dosages des acides gras volatils
1.4.3. Analyse du microbiote
1.5. Calculs réalisés
1.6. Analyse statistique
2. Résultats et discussion
2.1. Evolution et comparaison du pH sur 5 jours de culture
2.2. Evolution et comparaison de la production d’acides gras volatils sur 5 jours de culture
2.2.1. Quantités d’AGV totaux
2.2.2. Rapport C2/C3
2.3. Comparaison des activités microbiennes sur 3 heures entre J1 et J5
2.3.1. Caractérisation de l’inoculum de départ
2.3.2. Comparaison des deux types de milieux
2.3.3. Comparaison de l’ajout ou non d’acide linoléique dans les milieux
2.4. Evolution et comparaison du microbiote sur 5 jours de culture
2.4.1. A l’échelle des phyla
2.4.2. A l’échelle des genres
2.5. Corrélations
2.5.1. Entre microbiote et pH
2.5.2. Entre microbiote et production d’acides gras volatils
2.5.3. Entre microbiote et biohydrogénation
2.5.4. Entre les différents genres bactériens
CONCLUSION
Références bibliographiques
Annexes